В AG 101 (101-й рік календаря Advanced Generation) таємнича сутність, відома лише під назвою «UE», або «невідомий ворог», атакує і знищує космічну колонію Ангел. Ця жорстока атака стає сумнозвісною як “День, коли впав ангел”, і знаменує собою початок війни людства за виживання. Серія починається в AG 108, коли УП атакує космічну колонію Ован, де Фліт Асуно зараз живе після того, як врятувався з колонії Ангел до її знищення. Мати Фліта незадовго до того, як її вбиває UE, вона дарує синові предмет, який називається "AGE Device". У ній він виявляє схеми потужної зброї минулого - древнього месії на ім'я "Гундам".
З цих проектів Фліт проводить наступні кілька років, вивчаючи техніку на базі Федерації Землі в космічній колонії Нора і розробляючи Гундам AGE-1. Сім років потому, в AG 115, Фліт завершує "Gundam AGE-1 Normal", точно так само, як UE атакує Нору, і використовує його, щоб допомогти екіпажу лінкора "Діва" Федерації в евакуації громадян колонії до її знищення. Твердо вирішивши розпочати бій в УП за те, що він двічі зруйнував його будинок, Фліт погоджується служити в мобільному підрозділі Діви, який пілотує Гундам. Отримавши достатньо даних та військової сили для встановлення курсу дій, екіпаж Діви та їх союзники розпочали успішну атаку, яка знищила таємну фортецю УЕ в астероїді Амбат. Там вони дізнаються, що UE насправді є нащадками нібито невдалої людської місії, відправленої колонізувати Марс, залишений мертвими Федерацією Землі, яка сформувала свою власну націю на червоній планеті під назвою Вейган.
